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www.qiagen.com/About-Us/Press-Releases/PressReleaseView/ - Optimierte und automatisierte Lösung für Next-Generation-Sequencing (NGS) wird viele Merkmale bieten, die für den routinemäßigen klinischen Einsatz erforderlich sind
- Entwicklung eines integrierten NGS-Ökosystems einschließlich Probenvorbereitung, genetischer Tests und Bioinformatik profitiert von QIAGENs Führungsposition bei Proben- und Testtechnologien
- Neue Verbrauchsmaterialien adressieren kritische Herausforderungen in bestehenden Arbeitsabläufen und erweitern QIAGENs Portfolio an „universellen" Lösungen zur Verwendung mit allen NGS-Systemen
Marco Island, Florida und Hilden, Deutschland, 20. Februar 2013 - QIAGEN N.V. (NASDAQ: QGEN; Frankfurt Prime Standard: QIA) gewährte heute neue Einblicke in seine Initiative im Bereich des Next-Generation-Sequencing (NGS), und stellte eine innovative Lösung für komplette Arbeitsabläufe im NGS von der Probe bis zum finalen Ergebnis vor. Damit soll die routinemäßige Anwendung dieser bahnbrechenden Technologie über die akademische Forschung hinaus in Bereichen wie der klinischen Forschung und Diagnostik ermöglicht werden. QIAGENs Lösung für Arbeitsabläufe im NGS - ein Ökosystem bestehend aus Produkten und Dienstleistungen zur Bereitstellung automatisierter Prozesse von der ursprünglichen Probe bis zum digitalen Ergebnis - wird diese Woche beim 14. jährlichen AGBT-Meeting (Advances in Genome Biology and Technology) in Marco Island, Florida, dem Fachpublikum vorgestellt. „Das Next-Generation-Sequencing hat tief greifende Auswirkungen auf die Life Science Forschung, die bestehenden Schwierigkeiten schränken jedoch eine breitere Verwendung der Technologie für klinische Zwecke ein. Wir sind mit dem Fortschritt unserer NGS-Initiative zur Entwicklung eines kompletten Portfolios an Produkten und Dienstleistungen, das diese bahnbrechende Technologie für Bereiche wie die klinische Forschung und Diagnostik effizienter, robuster und skalierbarer gestalten soll, sehr zufrieden", sagte Peer M. Schatz, Chief Executive Officer von QIAGEN. „Die Entwicklung unseres vollständigen Arbeitsablaufs von der Probe zum Ergebnis ist ein wichtiger Meilenstein im Rahmen unserer Initiative zur nahtlosen Integration neuer NGS-Plattformen mit hochwertigen Reagenzien, molekularen Testinhalten und Dienstleistungen." „Wir nutzen unsere Kernkompetenzen mit neuen und bestehenden QIAGEN-Produkten, um Lösungen zu entwickeln, die die Verbreitung von NGS-Technologien in neue Bereiche jenseits der Grundlagenforschung ermöglichen", sagte Dr. Dietrich Hauffe, Senior Vice President, Life Science Business Area bei QIAGEN. „Wir planen, im Verlauf des Jahres 2013 mit der Platzierung unserer NGS-Arbeitsabläufe bei ausgewählten Kunden zu beginnen. Wir erwarten, dass NGS bewährte molekulare Technologien, insbesondere die Echtzeit-PCR, ergänzen und erheblich zum weiteren Ausbau von QIAGENs Führungsposition im Bereich der Proben- und Testtechnologien beitragen wird." Der Verbreitung von NGS in Bereiche wie der klinischen Forschung und Diagnostik standen bislang zahlreiche Hindernisse im Wege. Dazu zählen insbesondere Schwierigkeiten in den Arbeitsabläufen, die im klinischen Umfeld - zum Teil aufgrund einer höheren Anzahl der zu verarbeitenden Proben - stärker ins Gewicht fallen. Andere Herausforderungen bestehen in manuellen Probenvorbereitungsprozessen, zeitlichen Verzögerungen durch die Stapelverarbeitung von Proben zur Steigerung der Kosteneffizienz einzelner Sequenzierläufe, sowie in der Geschwindigkeit und Qualität der Datenanalyse. QIAGENs hoch automatisierte NGS-Lösung adressiert diese Schwierigkeiten und bietet einen optimierten und automatisierten Arbeitsablauf u. a. basierend auf folgenden Komponenten: - QIAGENs QIAcube® für die voll automatisierte Isolierung und Aufreinigung von Nukleinsäuren sowie die Erstellung von Sequenzierungsbibliotheken (library preparation).
- Neue GeneReadTM DNAseq Genpanels zur Anreicherung der zu untersuchenden Gensequenzen. Die Tests basieren auf der GeneGlobe® Sammlung von mehr als 60.000 vollständig annotierten molekularen Tests und sind speziell für NGS-Anwendungen konzipiert.
- QIAcube NGS - ein neues Instrument auf Basis des QIAcube für die automatisierte Vorbereitung der Sequenzierungsmatrizen (template preparation).
- GeneReaderTM - ein neuer NGS-Benchtop-Sequenzierer, der sich durch viele für Arbeitsabläufe in der Diagnostik relevante Leistungsmerkmale auszeichnet und ein hohes Maß an Flexibilität, Skalierbarkeit und Effizienz gewährleistet.
- Eine dedizierte Softwarelösung von QIAGEN für eine benutzerfreundliche und automatisierte Ergebnisanalyse.
Ein Schlüsselelement des NGS-Workflows von QIAGEN ist der GeneReader. Dieses bahnbrechende NGS-Benchtop-Sequenziergerät zeichnet sich durch viele Merkmale aus, die für Kunden in der klinischen Forschung und Diagnostik von elementarer Bedeutung sind, um im routinemäßigen Laborprozess implementiert werden zu können. Im Gegensatz zu den bestehenden NGS-Plattformen der Mitbewerber - die jeweils nur eine Durchflusszelle pro Durchlauf verarbeiten können und zur Erzielung kosteneffizienter Durchläufe häufig die Bündelung von Proben erfordern - verfügt QIAGENs NGS-Sequenzierer über ein Rotationsdesign und kann kontinuierlich mit bis zu 20 Durchflusszellen für eine unabhängige und parallele Sequenzierung beladen werden. Zudem können einzelne Patientenproben kosteneffizient ohne die Notwendigkeit zur Indexierung oder Barcode-Kennzeichnung verarbeitet werden. Hierdurch kann die Verarbeitung jederzeit und in beliebiger Reihenfolge stattfinden, ohne Verzögerungen zu riskieren oder Bedenken zu potenziellen regulatorischen Problemen aufkommen zu lassen. QIAGEN hat die SBS-Chemie (Sequencing-by-Synthesis) exklusiv für seinen NGS-Workflow lizenziert. Die Technologie erlaubt dank einer einzigartigen Kombination von unmarkierten und mit Fluorophor markierten „terminierenden Nukleotiden" äußerst kosteneffiziente Sequenzierdurchläufe. Die chemischen Eigenschaften der Reagenzien stehen darüber hinaus für eine sehr hohe Sequenzierungsgenauigkeit mit schwierigen DNA-Motiven wie den DNA-Homopolymeren, die sich für die Sequenzierungschemien von Mitbewerbern als problematisch erwiesen haben. Das Programm zur Entwicklung kompletter NGS-Arbeitsabläufe verläuft wie geplant und befindet sich derzeit in der „Verifizierungsphase" der Entwicklung. Die Arbeitsabläufe werden derzeit Tests unterzogen, um sicherzustellen, dass die Kundenansprüche an Leistung und Zuverlässigkeit erfüllt werden. Ein NGS-Arbeitsablauf auf Basis der modularen Automationsplattform QIAsymphony® befindet sich ebenfalls in der Entwicklung. Außerdem arbeitet QIAGEN zusammen mit der SAP AG an einem Bioinformatikprojekt, das die für die Analyse der Sequenzierungsdaten erforderliche Zeit durch Nutzung der SAP HANA® Plattform signifikant reduzieren soll. Einführung neuer „universeller" NGS-Verbrauchsprodukte QIAGEN hat zwei weitere „universelle" NGS-Verbrauchsprodukte auf dem Markt eingeführt, die mit den derzeit am Markt erhältlichen NGS-Instrumenten kompatibel sind: - GeneRead DNA Library Prep Kits - ermöglichen eine bis zu 50% schnellere Vorbereitung der DNA-Sequenzierungsbibliothek mit hohen Ausbeuten selbst aus kleinen Proben bis zu 50Nanogramm
- GeneRead Size Selection Kit - eine benutzerfreundliche und effiziente Methode zur Vorbereitung der NGS-Bibliothek
QIAGEN hat seine NGS-Initiative Ende 2012 zusammen mit vier Produkten zur Vereinfachung der Probenvorbereitung und weiterer präanalytischer Schritte, sowie mit neun Krebs-Genpanels auf Basis des GeneGlobe Portfolios aus mehr als 60.000 annotierten molekularen Tests, die eine zielgerichtete NGS-Analyse der betreffenden Gene erlauben, gestartet. Die anfängliche Nachfrage für diese „universellen" Produkte, die auf jeder NGS-Plattform verwendet werden können, ist sehr hoch.
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